Хелен стала известной благодаря главным ролям в телевизионных фильмах и в постановках британских театров. В кинофильмах в основном появляется в эпизодических ролях, включая такие фильмы как «Интервью с вампиром» (1994), «Казанова» (2005) и «Джейн Остин» (2007). Наиболее известна в кинематографе благодаря роли супруги премьер-министра Великобритании Тони Блэра Шери Блэр в биографическом фильме «Королева» (2006), озвучиванию миссис Бин в мультфильме «Бесподобный мистер Фокс» (2009).
Хелен родилась в Лондоне в семье шотландского дипломата Яна МакКрори и валлийского физиотерапевта Энн МакКрори. Хелен старшая из трёх детей в семье: её младшую сестру зовут Кэтрин, брата — Джон. Из-за дипломатической карьеры мистера МакКрори семья Хелен ездила по всему свету, и в детстве ей удалось побывать в разных странах: в странах Скандинавии, Нигерии, Камеруне, Танзании, во Франции и на острове Мадагаскар. Больше всего будущей актрисе запомнилась Танзания, где Хелен жила в городе Дар-эс-Салам с шести до девяти лет. В Лондон МакКрори вернулась в 18 лет.
Получила образование в школе-интернате для девочек «Queenswood», находящейся в городе Хатфилд (графство Хартфордшир, Англия, Великобритания). Окончив обучение, Хелен подала заявку на получение дальнейшего образования в Лондонском Драматическом Центре одном из отделений Лондонского Университета Искусств, но её кандидатура была отклонена. Тогда Хелен уехала и провела год, путешествуя по миру, побывав в Париже, Таиланде и Италии. Вернувшись в Англию, она вновь попыталась поступить, и на этот раз была принята.
Окончив в 1990 году обучение в центре Драмы, МакКрори начала принимать участия в постановках британских театров. Первые её роли в театральных постановках были положительно оценены критиками. Одной из самых известных ролей Хелен в театре был спектакль «Дядя Ваня», поставленный по мотивам одноимённой пьесы Чехова.
На экране Хелен дебютировала в 1993 году, снявшись в четвёртом эпизоде комедийного телесериала «Full Stretch». В 1994 году состоялся дебют актрисы в кино — она сыграла эпизодическую роль новоорлеанской проститутки в фильме «Интервью с вампиром», интерпретации романа американской писательницы Энн Райс. В этом же году Хелен появилась в фильме «Фламандская доска», режиссёром которой стал Джим Макбрайд, где исполнила роль одного из центральных персонажей.
В 1995 года Хелен в паре с актером Рисом Ивансом участвовала в съемках фильма «Streetlife». Замечательная игра актрисы удостоилась трёх премий, одной из которых стала валлийский BAFTA.
Популярность к актрисе пришла после выхода на экраны мини-сериала «Анна Каренина», интерпретации одноимённого романа Л. Толстого, где исполнила главную роль, и съёмке в телефильме «Северная площадь». В обоих фильмах её партнёром был Кевин Маккидд. Игра в фильме «Северная площадь» принесла Хелен премию «Broadcasting Press Guild Awards» в номинации «Лучшая актриса».
В сфере кинематографа Хелен стала знаменитой после выхода фильма «Королева», в котором сыграла королевского адвоката, а также супруги премьер-министра Великобритании Тони Блэра Шери Блэр.
Вторым наиболее известным фильмом с участием Хелен стал Гарри Поттер. Кастинг фильма Гарри Поттер и Орден Феникса стартовал в мае 2005 года, сразу же после того, как исполнитель главной роли в прошлых фильмах о Гарри Поттере, Дэниэл Редклифф, объявил, что остаётся в проекте. Одной из важных задач для съёмочной команды стал выбор актрисы на роль Беллатриссы Лестрейндж. Уже в августе 2005 в Интернет и СМИ просочился слух, что роль исполнит Хелен. 2 февраля 2006 года эта информация была официально подтверждена.
Однако в апреле 2006 года Хелен объявила, что находится на 3-ем месяце беременности. Одна из последних сцен с её участием — битва в Министерстве магии — должна была сниматься в сентябре, когда Хелен будет не в состоянии участвовать в съёмках сражений. По собственному признанию актрисы, по этой же причине страховая компания не разрешила выполнять трюки в фильме. 25 мая 2006 года было объявлено, что роль исполнит британская актриса Хелена Бонэм Картер.
Однако МакКрори вернулась в проект в следующем фильме, но уже в качестве Нарциссы Малфой. Изначально было объявлено, что Нарциссу сыграет Наоми Уоттс, но это информацию опровергли агенты актрисы. Съёмки начались 24 сентября 2007 года. Хелен говорила, что желает скорее приступить к съёмкам и радуется возможности поработать с Дэвидом Йейтсом.
4 июля 2007 года МакКрори вышла замуж за актёра Дамиана Льюиса, с которым познакомилась около театра Алмейда. Его фильмография включает такие фильмы как «Братья по оружию», «Ловец снов», «Незаконченная жизнь» и «Громобой». 2 ноября 2007 года у них родился сын Гуливер, которого они назвали так, «потому что в то время Дамиан работал с актёром, исполняющим роль в фильме «Путешествие Гулливера», и им обоим понравилось это имя. 8 сентября 2008 года родилась дочь Манон. Это валлийское имя.